Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI8

Cxxc4, CXXC-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc4Q6NXI8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc4Q6NXI8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc4Q6NXI8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms