Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rprd2Q6NXI6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rprd2Q6NXI6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rprd2Q6NXI6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms