Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HelbQ6NVF4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HelbQ6NVF4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms