Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ltv1Q6NSQ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ltv1Q6NSQ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms