Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc66Q6NS45 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc66Q6NS45 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms