Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arhgap20Q6IFT4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms