Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nckap5lQ6GQX2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nckap5lQ6GQX2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms