Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop58Q6DFW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms