Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6DFW0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q6DFW0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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