Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2cQ69ZS6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2cQ69ZS6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms