Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cntn4Q69Z26 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cntn4Q69Z26 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms