Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp4eQ66X19 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp4eQ66X19 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms