Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q66JV7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q66JV7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q66JV7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q66JV7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q66JV7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q66JV7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q66JV7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q66JV7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q66JV7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q66JV7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q66JV7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q66JV7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms