Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SrmQ64674 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrmQ64674 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms