Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Top2bQ64511 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Top2bQ64511 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Top2bQ64511 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms