Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tbr1Q64336 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbr1Q64336 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms