Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ly6eQ64253 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ly6eQ64253 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms