Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nup62Q63850 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nup62Q63850 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nup62Q63850 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup62Q63850 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup62Q63850 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup62Q63850 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms