Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lcn4Q62472 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn4Q62472 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms