Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lcn3Q62471 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms