Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vat1Q62465 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vat1Q62465 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms