Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Hoxa13Q62424 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Hoxa13Q62424 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa13Q62424 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Hoxa13Q62424 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa13Q62424 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms