Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sh3gl2Q62420 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Sh3gl2Q62420 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3gl2Q62420 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms