Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha6Q62413 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms