Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgfbr2Q62312 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms