Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms