Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Kdm5dQ62240 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm5dQ62240 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5dQ62240 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5dQ62240 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms