Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpaQ62189 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpaQ62189 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms