Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prm3Q62100 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms