Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkciQ62074 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms