Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HlxQ61670 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HlxQ61670 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms