Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes3Q61657 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms