Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcanQ61361 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BcanQ61361 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms