Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgef1Q61210 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgef1Q61210 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgef1Q61210 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arhgef1Q61210 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef1Q61210 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms