Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxg1Q60987 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms