Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
JrkQ60976 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
JrkQ60976 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
JrkQ60976 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
JrkQ60976 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms