Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vdac3Q60931 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vdac3Q60931 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms