Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DbpQ60925 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms