Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samhd1Q60710 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samhd1Q60710 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms