Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ItgaeQ60677 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ItgaeQ60677 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms