Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sik1Q60670 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sik1Q60670 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sik1Q60670 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms