Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tdrd5Q5VCS6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd5Q5VCS6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms