Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms