Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc88aQ5SNZ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms