Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbm27Q5SFM8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms