Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Brsk1Q5RJI5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk1Q5RJI5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Brsk1Q5RJI5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Brsk1Q5RJI5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Brsk1Q5RJI5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Brsk1Q5RJI5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Brsk1Q5RJI5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk1Q5RJI5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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