Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlha9Q5RJB0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlha9Q5RJB0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms