Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZK1

Cep44, Centrosomal protein of 44 kDa, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep44Q5HZK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep44Q5HZK1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep44Q5HZK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms