Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp22Q5DU02 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms