Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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